нет, не так. строчки начинающиеся с #Start и #End копировать в конфиг не обязательно, тем более их раскомменировать, это просто подсказки, а не кусок конфига.
прочти мой предъидущий пост внимательнее
там я полностью привел что в каком файле должно оказаться.
rndc это не обязательная тулза, просто она создает удобство управления и получения статистики
ты можешь её и не прикручивать и рестартить другими методами.